宅基地房产确权由自然资源部门负责，法律依据为《不动产登记暂行条例》。
根据《不动产登记暂行条例》第七条，不动产登记由不动产所在地的县级人民政府不动产登记机构办理。宅基地房产属于不动产，确权登记由县级自然资源部门（即不动产登记机构）负责。
具体操作：宅基地使用权与房屋所有权登记通常一并申请，需向属地县级自然资源部门提交宅基地使用权证明、房屋建设审批文件、身份证明等材料。跨县级区域的，由相关登记机构协商或上级指定办理。
结论：确权申请须在属地县级自然资源部门办理，材料齐全、权属清晰即可完成登记。
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宅基地房产确权的第一步是向自然资源部门申请，由县级自然资源部门具体负责。
不同情形处理方式：
1. 已取得使用权证且无争议：可直接申请房屋确权登记。
2. 使用权有争议：先经村委会调解或法院诉讼确权，再申请。
3. 未办使用权证：先向村集体申请确权宅基地使用权，再办房屋确权。
4. 建设未获批：需补办手续后再确权。
5. 使用权人去世：继承人凭继承证明申请继承确权。
6. 历史遗留问题（如“无证老宅”）：按当地政策补正材料后申请。
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宅基地房产确权中，常见错误操作会影响结果：
1. 权属未核实即申请：若宅基地本身权属不清或有争议，申请可能被驳回。
2. 提交虚假/过期材料：如伪造证明或用过期证件，不仅影响确权，还可能担责。
3. 忽视历史遗留问题：部分无证宅基地因历史原因未确权，不补正材料可能无法完成。
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宅基地房产确权可能受以下特殊情况影响：
1. 权属争议：自然资源部门会暂缓确权，需通过调解或诉讼明确权属后继续。
2. 政策调整：地方若出台新宅基地管理政策，可能改变确权标准和流程，影响原申请。
3. 建设未获批：未经审批的房屋可能被认定为违建，无法确权登记。
这些情况会影响确权进程，建议提前评估并准备应对措施。

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